El manejo sostenible de los bosques naturales tropicales es  considerado la herramienta más importante para su conservación. Ahora bien, no es posible manejar estos ecosistemas si no los conocemos. Dada su gran diversidad, los bosques pueden ser clasificados de acuerdo con parámetros como el área basal, composición florística y características de especies dominantes. Sin embargo, para medir el éxito de las intervenciones silviculturales es necesario contar con datos de crecimiento, rendimiento, reclutamiento y mortalidad, de las especies y de los rodales. Es por esta razón que el monitoreo de los bosques naturales es un componente indispensable del sistema silvicultural seleccionado. Las parcelas permanentes de muestreo son el método más utilizado a nivel mundial para determinar parámetros que cambian en el tiempo y reflejan la condición de los bosques. No obstante, es necesario estandarizar algunos conceptos con el fin de ayudar a compartir información clave por parte de los investigadores y de esta manera evolucionar en la comprensión global de estos ecosistemas. Es por esto por lo que se presenta este protocolo, como un punto de inicio para construir la base del conocimiento anhelado.